Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRMT13Q9NUP7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRMT13Q9NUP7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRMT13Q9NUP7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TRMT13Q9NUP7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRMT13Q9NUP7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRMT13Q9NUP7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRMT13Q9NUP7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRMT13Q9NUP7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRMT13Q9NUP7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TRMT13Q9NUP7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRMT13Q9NUP7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRMT13Q9NUP7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRMT13Q9NUP7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRMT13Q9NUP7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRMT13Q9NUP7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRMT13Q9NUP7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRMT13Q9NUP7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRMT13Q9NUP7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRMT13Q9NUP7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRMT13Q9NUP7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRMT13Q9NUP7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRMT13Q9NUP7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRMT13Q9NUP7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRMT13Q9NUP7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRMT13Q9NUP7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRMT13Q9NUP7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRMT13Q9NUP7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRMT13Q9NUP7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRMT13Q9NUP7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRMT13Q9NUP7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRMT13Q9NUP7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TRMT13Q9NUP7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRMT13Q9NUP7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRMT13Q9NUP7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRMT13Q9NUP7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms