Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TREX1Q9NSU2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TREX1Q9NSU2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TREX1Q9NSU2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TREX1Q9NSU2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TREX1Q9NSU2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TREX1Q9NSU2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TREX1Q9NSU2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TREX1Q9NSU2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TREX1Q9NSU2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TREX1Q9NSU2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TREX1Q9NSU2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TREX1Q9NSU2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TREX1Q9NSU2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TREX1Q9NSU2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TREX1Q9NSU2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TREX1Q9NSU2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TREX1Q9NSU2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TREX1Q9NSU2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms