Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTPS2Q9NRF8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTPS2Q9NRF8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTPS2Q9NRF8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms