Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA1

PDGFC, Platelet-derived growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFCQ9NRA1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDGFCQ9NRA1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PDGFCQ9NRA1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDGFCQ9NRA1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDGFCQ9NRA1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDGFCQ9NRA1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PDGFCQ9NRA1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDGFCQ9NRA1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PDGFCQ9NRA1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDGFCQ9NRA1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDGFCQ9NRA1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PDGFCQ9NRA1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDGFCQ9NRA1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDGFCQ9NRA1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDGFCQ9NRA1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDGFCQ9NRA1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PDGFCQ9NRA1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDGFCQ9NRA1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDGFCQ9NRA1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDGFCQ9NRA1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDGFCQ9NRA1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDGFCQ9NRA1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDGFCQ9NRA1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDGFCQ9NRA1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDGFCQ9NRA1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDGFCQ9NRA1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDGFCQ9NRA1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDGFCQ9NRA1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDGFCQ9NRA1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDGFCQ9NRA1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PDGFCQ9NRA1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDGFCQ9NRA1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PDGFCQ9NRA1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms