Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FSCN3Q9NQT6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FSCN3Q9NQT6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FSCN3Q9NQT6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FSCN3Q9NQT6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FSCN3Q9NQT6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FSCN3Q9NQT6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FSCN3Q9NQT6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FSCN3Q9NQT6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSCN3Q9NQT6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FSCN3Q9NQT6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FSCN3Q9NQT6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FSCN3Q9NQT6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FSCN3Q9NQT6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FSCN3Q9NQT6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FSCN3Q9NQT6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FSCN3Q9NQT6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FSCN3Q9NQT6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FSCN3Q9NQT6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSCN3Q9NQT6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSCN3Q9NQT6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSCN3Q9NQT6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSCN3Q9NQT6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FSCN3Q9NQT6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FSCN3Q9NQT6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FSCN3Q9NQT6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FSCN3Q9NQT6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FSCN3Q9NQT6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FSCN3Q9NQT6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FSCN3Q9NQT6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FSCN3Q9NQT6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FSCN3Q9NQT6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FSCN3Q9NQT6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms