Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG3

UBN1, Ubinuclein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBN1Q9NPG3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBN1Q9NPG3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBN1Q9NPG3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBN1Q9NPG3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBN1Q9NPG3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBN1Q9NPG3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBN1Q9NPG3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBN1Q9NPG3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBN1Q9NPG3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBN1Q9NPG3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBN1Q9NPG3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
UBN1Q9NPG3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
UBN1Q9NPG3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBN1Q9NPG3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBN1Q9NPG3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBN1Q9NPG3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBN1Q9NPG3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBN1Q9NPG3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBN1Q9NPG3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBN1Q9NPG3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBN1Q9NPG3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBN1Q9NPG3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBN1Q9NPG3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBN1Q9NPG3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
UBN1Q9NPG3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBN1Q9NPG3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBN1Q9NPG3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBN1Q9NPG3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBN1Q9NPG3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
UBN1Q9NPG3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBN1Q9NPG3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBN1Q9NPG3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBN1Q9NPG3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
UBN1Q9NPG3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBN1Q9NPG3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms