Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NTN4Q9HB63 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NTN4Q9HB63 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms