Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
UPF2Q9HAU5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
UPF2Q9HAU5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
UPF2Q9HAU5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
UPF2Q9HAU5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
UPF2Q9HAU5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
UPF2Q9HAU5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
UPF2Q9HAU5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
UPF2Q9HAU5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
UPF2Q9HAU5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
UPF2Q9HAU5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
UPF2Q9HAU5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
UPF2Q9HAU5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
UPF2Q9HAU5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
UPF2Q9HAU5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
UPF2Q9HAU5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
UPF2Q9HAU5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
UPF2Q9HAU5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UPF2Q9HAU5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UPF2Q9HAU5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UPF2Q9HAU5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UPF2Q9HAU5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UPF2Q9HAU5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
UPF2Q9HAU5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
UPF2Q9HAU5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
UPF2Q9HAU5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
UPF2Q9HAU5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
UPF2Q9HAU5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
UPF2Q9HAU5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
UPF2Q9HAU5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
UPF2Q9HAU5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
UPF2Q9HAU5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
UPF2Q9HAU5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
UPF2Q9HAU5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
UPF2Q9HAU5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
UPF2Q9HAU5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
UPF2Q9HAU5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
UPF2Q9HAU5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
UPF2Q9HAU5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
UPF2Q9HAU5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
UPF2Q9HAU5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
UPF2Q9HAU5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
UPF2Q9HAU5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
UPF2Q9HAU5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
UPF2Q9HAU5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
UPF2Q9HAU5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
UPF2Q9HAU5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
UPF2Q9HAU5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UPF2Q9HAU5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UPF2Q9HAU5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
UPF2Q9HAU5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UPF2Q9HAU5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
UPF2Q9HAU5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
UPF2Q9HAU5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
UPF2Q9HAU5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UPF2Q9HAU5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
UPF2Q9HAU5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UPF2Q9HAU5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
UPF2Q9HAU5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UPF2Q9HAU5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UPF2Q9HAU5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
UPF2Q9HAU5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
UPF2Q9HAU5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
UPF2Q9HAU5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
UPF2Q9HAU5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UPF2Q9HAU5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UPF2Q9HAU5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UPF2Q9HAU5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UPF2Q9HAU5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UPF2Q9HAU5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UPF2Q9HAU5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UPF2Q9HAU5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
UPF2Q9HAU5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UPF2Q9HAU5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
UPF2Q9HAU5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
UPF2Q9HAU5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
UPF2Q9HAU5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
UPF2Q9HAU5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UPF2Q9HAU5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UPF2Q9HAU5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UPF2Q9HAU5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UPF2Q9HAU5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UPF2Q9HAU5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
UPF2Q9HAU5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
UPF2Q9HAU5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
UPF2Q9HAU5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
UPF2Q9HAU5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
UPF2Q9HAU5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
UPF2Q9HAU5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
UPF2Q9HAU5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
UPF2Q9HAU5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
UPF2Q9HAU5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UPF2Q9HAU5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
UPF2Q9HAU5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UPF2Q9HAU5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UPF2Q9HAU5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UPF2Q9HAU5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
UPF2Q9HAU5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
UPF2Q9HAU5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
UPF2Q9HAU5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.3 ms