Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4F8

SMOC1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOC1Q9H4F8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMOC1Q9H4F8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMOC1Q9H4F8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMOC1Q9H4F8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMOC1Q9H4F8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMOC1Q9H4F8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMOC1Q9H4F8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMOC1Q9H4F8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMOC1Q9H4F8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMOC1Q9H4F8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMOC1Q9H4F8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMOC1Q9H4F8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMOC1Q9H4F8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMOC1Q9H4F8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMOC1Q9H4F8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMOC1Q9H4F8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMOC1Q9H4F8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMOC1Q9H4F8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMOC1Q9H4F8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMOC1Q9H4F8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMOC1Q9H4F8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMOC1Q9H4F8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMOC1Q9H4F8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMOC1Q9H4F8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMOC1Q9H4F8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMOC1Q9H4F8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMOC1Q9H4F8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMOC1Q9H4F8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMOC1Q9H4F8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMOC1Q9H4F8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMOC1Q9H4F8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMOC1Q9H4F8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMOC1Q9H4F8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMOC1Q9H4F8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMOC1Q9H4F8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMOC1Q9H4F8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMOC1Q9H4F8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMOC1Q9H4F8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMOC1Q9H4F8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMOC1Q9H4F8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMOC1Q9H4F8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMOC1Q9H4F8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMOC1Q9H4F8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMOC1Q9H4F8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMOC1Q9H4F8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMOC1Q9H4F8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMOC1Q9H4F8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMOC1Q9H4F8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMOC1Q9H4F8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMOC1Q9H4F8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMOC1Q9H4F8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMOC1Q9H4F8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMOC1Q9H4F8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMOC1Q9H4F8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMOC1Q9H4F8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMOC1Q9H4F8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMOC1Q9H4F8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMOC1Q9H4F8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMOC1Q9H4F8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMOC1Q9H4F8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMOC1Q9H4F8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMOC1Q9H4F8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMOC1Q9H4F8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMOC1Q9H4F8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMOC1Q9H4F8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMOC1Q9H4F8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMOC1Q9H4F8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMOC1Q9H4F8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMOC1Q9H4F8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMOC1Q9H4F8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms