Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC113Q9H0I3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC113Q9H0I3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC113Q9H0I3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC113Q9H0I3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC113Q9H0I3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC113Q9H0I3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC113Q9H0I3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC113Q9H0I3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC113Q9H0I3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC113Q9H0I3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC113Q9H0I3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC113Q9H0I3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC113Q9H0I3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC113Q9H0I3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC113Q9H0I3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC113Q9H0I3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC113Q9H0I3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC113Q9H0I3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC113Q9H0I3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC113Q9H0I3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC113Q9H0I3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC113Q9H0I3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC113Q9H0I3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC113Q9H0I3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC113Q9H0I3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC113Q9H0I3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC113Q9H0I3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC113Q9H0I3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC113Q9H0I3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC113Q9H0I3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC113Q9H0I3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC113Q9H0I3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms