Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPRTNQ9H040 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRTNQ9H040 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPRTNQ9H040 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPRTNQ9H040 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPRTNQ9H040 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPRTNQ9H040 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPRTNQ9H040 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPRTNQ9H040 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPRTNQ9H040 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPRTNQ9H040 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SPRTNQ9H040 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPRTNQ9H040 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SPRTNQ9H040 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPRTNQ9H040 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPRTNQ9H040 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPRTNQ9H040 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPRTNQ9H040 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPRTNQ9H040 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPRTNQ9H040 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPRTNQ9H040 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPRTNQ9H040 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SPRTNQ9H040 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPRTNQ9H040 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPRTNQ9H040 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPRTNQ9H040 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPRTNQ9H040 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPRTNQ9H040 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPRTNQ9H040 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SPRTNQ9H040 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.8 ms