Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
LNPKQ9C0E8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LNPKQ9C0E8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LNPKQ9C0E8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LNPKQ9C0E8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LNPKQ9C0E8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LNPKQ9C0E8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LNPKQ9C0E8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LNPKQ9C0E8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LNPKQ9C0E8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LNPKQ9C0E8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LNPKQ9C0E8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LNPKQ9C0E8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
LNPKQ9C0E8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LNPKQ9C0E8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LNPKQ9C0E8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LNPKQ9C0E8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LNPKQ9C0E8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
LNPKQ9C0E8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LNPKQ9C0E8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LNPKQ9C0E8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LNPKQ9C0E8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LNPKQ9C0E8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LNPKQ9C0E8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LNPKQ9C0E8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LNPKQ9C0E8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LNPKQ9C0E8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LNPKQ9C0E8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LNPKQ9C0E8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LNPKQ9C0E8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LNPKQ9C0E8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
LNPKQ9C0E8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LNPKQ9C0E8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms