Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHACTR1Q9C0D0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHACTR1Q9C0D0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHACTR1Q9C0D0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHACTR1Q9C0D0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHACTR1Q9C0D0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHACTR1Q9C0D0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHACTR1Q9C0D0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHACTR1Q9C0D0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PHACTR1Q9C0D0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHACTR1Q9C0D0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHACTR1Q9C0D0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHACTR1Q9C0D0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHACTR1Q9C0D0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHACTR1Q9C0D0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHACTR1Q9C0D0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHACTR1Q9C0D0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHACTR1Q9C0D0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHACTR1Q9C0D0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHACTR1Q9C0D0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHACTR1Q9C0D0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHACTR1Q9C0D0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHACTR1Q9C0D0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHACTR1Q9C0D0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHACTR1Q9C0D0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHACTR1Q9C0D0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHACTR1Q9C0D0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHACTR1Q9C0D0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PHACTR1Q9C0D0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHACTR1Q9C0D0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PHACTR1Q9C0D0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHACTR1Q9C0D0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHACTR1Q9C0D0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHACTR1Q9C0D0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHACTR1Q9C0D0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHACTR1Q9C0D0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHACTR1Q9C0D0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHACTR1Q9C0D0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PHACTR1Q9C0D0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHACTR1Q9C0D0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHACTR1Q9C0D0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHACTR1Q9C0D0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHACTR1Q9C0D0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHACTR1Q9C0D0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHACTR1Q9C0D0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHACTR1Q9C0D0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PHACTR1Q9C0D0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHACTR1Q9C0D0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms