Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSDMCQ9BYG8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSDMCQ9BYG8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSDMCQ9BYG8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSDMCQ9BYG8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSDMCQ9BYG8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSDMCQ9BYG8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSDMCQ9BYG8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSDMCQ9BYG8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSDMCQ9BYG8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSDMCQ9BYG8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSDMCQ9BYG8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GSDMCQ9BYG8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSDMCQ9BYG8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSDMCQ9BYG8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSDMCQ9BYG8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSDMCQ9BYG8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSDMCQ9BYG8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSDMCQ9BYG8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSDMCQ9BYG8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSDMCQ9BYG8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSDMCQ9BYG8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GSDMCQ9BYG8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSDMCQ9BYG8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSDMCQ9BYG8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GSDMCQ9BYG8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSDMCQ9BYG8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSDMCQ9BYG8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSDMCQ9BYG8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GSDMCQ9BYG8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GSDMCQ9BYG8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSDMCQ9BYG8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSDMCQ9BYG8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSDMCQ9BYG8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSDMCQ9BYG8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSDMCQ9BYG8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSDMCQ9BYG8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSDMCQ9BYG8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.4 ms