Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXU9

CALN1, Calcium-binding protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALN1Q9BXU9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms