Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
BRIP1Q9BX63 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
BRIP1Q9BX63 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
BRIP1Q9BX63 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
BRIP1Q9BX63 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
BRIP1Q9BX63 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
BRIP1Q9BX63 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
BRIP1Q9BX63 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
BRIP1Q9BX63 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
BRIP1Q9BX63 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
BRIP1Q9BX63 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
BRIP1Q9BX63 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
BRIP1Q9BX63 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
BRIP1Q9BX63 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
BRIP1Q9BX63 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
BRIP1Q9BX63 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
BRIP1Q9BX63 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
BRIP1Q9BX63 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
BRIP1Q9BX63 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
BRIP1Q9BX63 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
BRIP1Q9BX63 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BRIP1Q9BX63 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BRIP1Q9BX63 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
BRIP1Q9BX63 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BRIP1Q9BX63 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
BRIP1Q9BX63 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BRIP1Q9BX63 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BRIP1Q9BX63 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BRIP1Q9BX63 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BRIP1Q9BX63 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BRIP1Q9BX63 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
BRIP1Q9BX63 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
BRIP1Q9BX63 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
BRIP1Q9BX63 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
BRIP1Q9BX63 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
BRIP1Q9BX63 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
BRIP1Q9BX63 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
BRIP1Q9BX63 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
BRIP1Q9BX63 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
BRIP1Q9BX63 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
BRIP1Q9BX63 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
BRIP1Q9BX63 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
BRIP1Q9BX63 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
BRIP1Q9BX63 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
BRIP1Q9BX63 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
BRIP1Q9BX63 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
BRIP1Q9BX63 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
BRIP1Q9BX63 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
BRIP1Q9BX63 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
BRIP1Q9BX63 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
BRIP1Q9BX63 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
BRIP1Q9BX63 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
BRIP1Q9BX63 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
BRIP1Q9BX63 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
BRIP1Q9BX63 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
BRIP1Q9BX63 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
BRIP1Q9BX63 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
BRIP1Q9BX63 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
BRIP1Q9BX63 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
BRIP1Q9BX63 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
BRIP1Q9BX63 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
BRIP1Q9BX63 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
BRIP1Q9BX63 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
BRIP1Q9BX63 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
BRIP1Q9BX63 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
BRIP1Q9BX63 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
BRIP1Q9BX63 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BRIP1Q9BX63 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BRIP1Q9BX63 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BRIP1Q9BX63 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BRIP1Q9BX63 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BRIP1Q9BX63 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BRIP1Q9BX63 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
BRIP1Q9BX63 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
BRIP1Q9BX63 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
BRIP1Q9BX63 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
BRIP1Q9BX63 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BRIP1Q9BX63 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
BRIP1Q9BX63 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BRIP1Q9BX63 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
BRIP1Q9BX63 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
BRIP1Q9BX63 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
BRIP1Q9BX63 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
BRIP1Q9BX63 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
BRIP1Q9BX63 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
BRIP1Q9BX63 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
BRIP1Q9BX63 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
BRIP1Q9BX63 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
BRIP1Q9BX63 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
BRIP1Q9BX63 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms