Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC106Q9BWC9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC106Q9BWC9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC106Q9BWC9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms