Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFHD1Q9BUP0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EFHD1Q9BUP0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFHD1Q9BUP0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms