Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RSG1Q9BU20 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RSG1Q9BU20 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms