Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EBF4Q9BQW3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EBF4Q9BQW3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBF4Q9BQW3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms