Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CITED2Q99967 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CITED2Q99967 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CITED2Q99967 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms