Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
DCLRE1CQ96SD1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DCLRE1CQ96SD1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCLRE1CQ96SD1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DCLRE1CQ96SD1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DCLRE1CQ96SD1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DCLRE1CQ96SD1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DCLRE1CQ96SD1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCLRE1CQ96SD1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCLRE1CQ96SD1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCLRE1CQ96SD1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCLRE1CQ96SD1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCLRE1CQ96SD1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCLRE1CQ96SD1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms