Protein–RNA interactions for Protein: Q96S94

CCNL2, Cyclin-L2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL2Q96S94 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNL2Q96S94 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNL2Q96S94 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNL2Q96S94 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNL2Q96S94 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNL2Q96S94 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNL2Q96S94 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNL2Q96S94 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms