Protein–RNA interactions for Protein: Q96RI1

NR1H4, Bile acid receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H4Q96RI1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1H4Q96RI1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1H4Q96RI1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1H4Q96RI1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1H4Q96RI1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1H4Q96RI1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1H4Q96RI1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1H4Q96RI1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1H4Q96RI1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1H4Q96RI1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1H4Q96RI1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1H4Q96RI1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1H4Q96RI1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1H4Q96RI1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H4Q96RI1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H4Q96RI1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H4Q96RI1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H4Q96RI1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H4Q96RI1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1H4Q96RI1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H4Q96RI1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H4Q96RI1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H4Q96RI1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H4Q96RI1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H4Q96RI1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H4Q96RI1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR1H4Q96RI1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NR1H4Q96RI1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NR1H4Q96RI1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1H4Q96RI1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms