Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GCNAQ96QF7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GCNAQ96QF7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GCNAQ96QF7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GCNAQ96QF7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCNAQ96QF7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCNAQ96QF7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
GCNAQ96QF7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GCNAQ96QF7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCNAQ96QF7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCNAQ96QF7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCNAQ96QF7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GCNAQ96QF7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCNAQ96QF7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GCNAQ96QF7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCNAQ96QF7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCNAQ96QF7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCNAQ96QF7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCNAQ96QF7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCNAQ96QF7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCNAQ96QF7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCNAQ96QF7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCNAQ96QF7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCNAQ96QF7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCNAQ96QF7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCNAQ96QF7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCNAQ96QF7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCNAQ96QF7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCNAQ96QF7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCNAQ96QF7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GCNAQ96QF7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCNAQ96QF7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCNAQ96QF7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCNAQ96QF7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCNAQ96QF7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCNAQ96QF7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms