Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
INPP4AQ96PE3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
INPP4AQ96PE3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
INPP4AQ96PE3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INPP4AQ96PE3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms