Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
FGD4Q96M96 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FGD4Q96M96 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FGD4Q96M96 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD4Q96M96 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms