Protein–RNA interactions for Protein: Q96LP6

C12orf42, Uncharacterized protein C12orf42, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf42Q96LP6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
C12orf42Q96LP6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
C12orf42Q96LP6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
C12orf42Q96LP6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
C12orf42Q96LP6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C12orf42Q96LP6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C12orf42Q96LP6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C12orf42Q96LP6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
C12orf42Q96LP6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
C12orf42Q96LP6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
C12orf42Q96LP6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C12orf42Q96LP6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C12orf42Q96LP6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C12orf42Q96LP6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
C12orf42Q96LP6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
C12orf42Q96LP6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C12orf42Q96LP6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C12orf42Q96LP6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C12orf42Q96LP6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C12orf42Q96LP6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C12orf42Q96LP6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C12orf42Q96LP6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C12orf42Q96LP6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C12orf42Q96LP6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C12orf42Q96LP6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C12orf42Q96LP6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C12orf42Q96LP6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C12orf42Q96LP6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C12orf42Q96LP6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
C12orf42Q96LP6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C12orf42Q96LP6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C12orf42Q96LP6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C12orf42Q96LP6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C12orf42Q96LP6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C12orf42Q96LP6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C12orf42Q96LP6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
C12orf42Q96LP6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C12orf42Q96LP6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C12orf42Q96LP6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C12orf42Q96LP6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C12orf42Q96LP6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C12orf42Q96LP6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C12orf42Q96LP6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C12orf42Q96LP6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C12orf42Q96LP6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C12orf42Q96LP6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C12orf42Q96LP6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C12orf42Q96LP6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
C12orf42Q96LP6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C12orf42Q96LP6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C12orf42Q96LP6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C12orf42Q96LP6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms