Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMX3Q96JJ7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMX3Q96JJ7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMX3Q96JJ7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMX3Q96JJ7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TMX3Q96JJ7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMX3Q96JJ7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMX3Q96JJ7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMX3Q96JJ7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMX3Q96JJ7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMX3Q96JJ7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMX3Q96JJ7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMX3Q96JJ7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMX3Q96JJ7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMX3Q96JJ7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMX3Q96JJ7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMX3Q96JJ7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMX3Q96JJ7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMX3Q96JJ7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMX3Q96JJ7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMX3Q96JJ7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TMX3Q96JJ7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TMX3Q96JJ7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TMX3Q96JJ7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TMX3Q96JJ7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMX3Q96JJ7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMX3Q96JJ7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMX3Q96JJ7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMX3Q96JJ7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMX3Q96JJ7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TMX3Q96JJ7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMX3Q96JJ7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms