Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
ABCC11Q96J66 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ABCC11Q96J66 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
ABCC11Q96J66 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
ABCC11Q96J66 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ABCC11Q96J66 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
ABCC11Q96J66 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ABCC11Q96J66 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ABCC11Q96J66 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.17
ABCC11Q96J66 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
ABCC11Q96J66 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ABCC11Q96J66 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ABCC11Q96J66 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ABCC11Q96J66 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ABCC11Q96J66 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ABCC11Q96J66 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ABCC11Q96J66 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ABCC11Q96J66 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ABCC11Q96J66 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ABCC11Q96J66 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ABCC11Q96J66 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ABCC11Q96J66 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ABCC11Q96J66 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ABCC11Q96J66 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ABCC11Q96J66 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ABCC11Q96J66 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ABCC11Q96J66 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ABCC11Q96J66 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ABCC11Q96J66 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ABCC11Q96J66 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ABCC11Q96J66 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ABCC11Q96J66 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
ABCC11Q96J66 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
ABCC11Q96J66 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
ABCC11Q96J66 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
ABCC11Q96J66 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
ABCC11Q96J66 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ABCC11Q96J66 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ABCC11Q96J66 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
ABCC11Q96J66 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ABCC11Q96J66 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ABCC11Q96J66 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ABCC11Q96J66 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ABCC11Q96J66 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ABCC11Q96J66 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ABCC11Q96J66 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ABCC11Q96J66 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ABCC11Q96J66 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ABCC11Q96J66 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ABCC11Q96J66 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
ABCC11Q96J66 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.15
ABCC11Q96J66 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ABCC11Q96J66 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
ABCC11Q96J66 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ABCC11Q96J66 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ABCC11Q96J66 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ABCC11Q96J66 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ABCC11Q96J66 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ABCC11Q96J66 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ABCC11Q96J66 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ABCC11Q96J66 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ABCC11Q96J66 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
ABCC11Q96J66 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ABCC11Q96J66 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ABCC11Q96J66 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ABCC11Q96J66 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
ABCC11Q96J66 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
ABCC11Q96J66 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ABCC11Q96J66 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ABCC11Q96J66 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ABCC11Q96J66 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ABCC11Q96J66 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ABCC11Q96J66 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ABCC11Q96J66 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ABCC11Q96J66 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
ABCC11Q96J66 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ABCC11Q96J66 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ABCC11Q96J66 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ABCC11Q96J66 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ABCC11Q96J66 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ABCC11Q96J66 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ABCC11Q96J66 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ABCC11Q96J66 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ABCC11Q96J66 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ABCC11Q96J66 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ABCC11Q96J66 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ABCC11Q96J66 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ABCC11Q96J66 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ABCC11Q96J66 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ABCC11Q96J66 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
ABCC11Q96J66 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ABCC11Q96J66 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ABCC11Q96J66 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ABCC11Q96J66 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ABCC11Q96J66 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ABCC11Q96J66 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ABCC11Q96J66 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ABCC11Q96J66 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ABCC11Q96J66 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ABCC11Q96J66 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms