Protein–RNA interactions for Protein: Q96HV5

TMEM41A, Transmembrane protein 41A, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41AQ96HV5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM41AQ96HV5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM41AQ96HV5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM41AQ96HV5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms