Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MFSD3Q96ES6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MFSD3Q96ES6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms