Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SIRT1Q96EB6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SIRT1Q96EB6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SIRT1Q96EB6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SIRT1Q96EB6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SIRT1Q96EB6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
SIRT1Q96EB6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SIRT1Q96EB6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SIRT1Q96EB6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SIRT1Q96EB6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SIRT1Q96EB6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SIRT1Q96EB6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SIRT1Q96EB6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
SIRT1Q96EB6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
SIRT1Q96EB6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SIRT1Q96EB6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SIRT1Q96EB6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SIRT1Q96EB6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
SIRT1Q96EB6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SIRT1Q96EB6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SIRT1Q96EB6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SIRT1Q96EB6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SIRT1Q96EB6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SIRT1Q96EB6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SIRT1Q96EB6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SIRT1Q96EB6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SIRT1Q96EB6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SIRT1Q96EB6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SIRT1Q96EB6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SIRT1Q96EB6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SIRT1Q96EB6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SIRT1Q96EB6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SIRT1Q96EB6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SIRT1Q96EB6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SIRT1Q96EB6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SIRT1Q96EB6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SIRT1Q96EB6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SIRT1Q96EB6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SIRT1Q96EB6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SIRT1Q96EB6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SIRT1Q96EB6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SIRT1Q96EB6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SIRT1Q96EB6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SIRT1Q96EB6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SIRT1Q96EB6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SIRT1Q96EB6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SIRT1Q96EB6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SIRT1Q96EB6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SIRT1Q96EB6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
SIRT1Q96EB6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
SIRT1Q96EB6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SIRT1Q96EB6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SIRT1Q96EB6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SIRT1Q96EB6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SIRT1Q96EB6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SIRT1Q96EB6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SIRT1Q96EB6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SIRT1Q96EB6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SIRT1Q96EB6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SIRT1Q96EB6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
SIRT1Q96EB6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
SIRT1Q96EB6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SIRT1Q96EB6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SIRT1Q96EB6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SIRT1Q96EB6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SIRT1Q96EB6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SIRT1Q96EB6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SIRT1Q96EB6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SIRT1Q96EB6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SIRT1Q96EB6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
SIRT1Q96EB6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SIRT1Q96EB6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SIRT1Q96EB6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SIRT1Q96EB6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SIRT1Q96EB6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SIRT1Q96EB6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SIRT1Q96EB6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SIRT1Q96EB6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SIRT1Q96EB6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SIRT1Q96EB6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SIRT1Q96EB6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SIRT1Q96EB6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SIRT1Q96EB6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SIRT1Q96EB6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SIRT1Q96EB6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
SIRT1Q96EB6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SIRT1Q96EB6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SIRT1Q96EB6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SIRT1Q96EB6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SIRT1Q96EB6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SIRT1Q96EB6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SIRT1Q96EB6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SIRT1Q96EB6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SIRT1Q96EB6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SIRT1Q96EB6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SIRT1Q96EB6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
SIRT1Q96EB6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SIRT1Q96EB6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SIRT1Q96EB6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SIRT1Q96EB6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms