Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3KBP1Q96B97 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3KBP1Q96B97 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3KBP1Q96B97 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3KBP1Q96B97 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3KBP1Q96B97 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3KBP1Q96B97 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms