Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y2

GTPBP3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP3Q969Y2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTPBP3Q969Y2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GTPBP3Q969Y2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTPBP3Q969Y2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms