Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM63Q969Q1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM63Q969Q1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRIM63Q969Q1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM63Q969Q1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.1 ms