Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF12Q8WXF0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF12Q8WXF0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF12Q8WXF0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF12Q8WXF0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF12Q8WXF0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF12Q8WXF0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF12Q8WXF0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF12Q8WXF0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF12Q8WXF0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF12Q8WXF0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF12Q8WXF0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF12Q8WXF0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF12Q8WXF0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF12Q8WXF0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF12Q8WXF0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF12Q8WXF0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF12Q8WXF0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF12Q8WXF0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF12Q8WXF0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.1 ms