Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DCAF4Q8WV16 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DCAF4Q8WV16 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DCAF4Q8WV16 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DCAF4Q8WV16 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DCAF4Q8WV16 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DCAF4Q8WV16 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DCAF4Q8WV16 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DCAF4Q8WV16 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DCAF4Q8WV16 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DCAF4Q8WV16 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DCAF4Q8WV16 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DCAF4Q8WV16 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DCAF4Q8WV16 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DCAF4Q8WV16 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DCAF4Q8WV16 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DCAF4Q8WV16 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
DCAF4Q8WV16 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
DCAF4Q8WV16 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
DCAF4Q8WV16 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DCAF4Q8WV16 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DCAF4Q8WV16 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DCAF4Q8WV16 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DCAF4Q8WV16 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
DCAF4Q8WV16 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DCAF4Q8WV16 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
DCAF4Q8WV16 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DCAF4Q8WV16 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DCAF4Q8WV16 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DCAF4Q8WV16 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DCAF4Q8WV16 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DCAF4Q8WV16 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DCAF4Q8WV16 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DCAF4Q8WV16 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DCAF4Q8WV16 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DCAF4Q8WV16 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DCAF4Q8WV16 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DCAF4Q8WV16 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DCAF4Q8WV16 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DCAF4Q8WV16 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DCAF4Q8WV16 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DCAF4Q8WV16 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DCAF4Q8WV16 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DCAF4Q8WV16 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DCAF4Q8WV16 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DCAF4Q8WV16 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DCAF4Q8WV16 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DCAF4Q8WV16 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
DCAF4Q8WV16 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DCAF4Q8WV16 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DCAF4Q8WV16 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DCAF4Q8WV16 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DCAF4Q8WV16 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DCAF4Q8WV16 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DCAF4Q8WV16 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DCAF4Q8WV16 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DCAF4Q8WV16 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DCAF4Q8WV16 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DCAF4Q8WV16 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DCAF4Q8WV16 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DCAF4Q8WV16 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DCAF4Q8WV16 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DCAF4Q8WV16 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DCAF4Q8WV16 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DCAF4Q8WV16 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DCAF4Q8WV16 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DCAF4Q8WV16 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DCAF4Q8WV16 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DCAF4Q8WV16 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DCAF4Q8WV16 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DCAF4Q8WV16 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
DCAF4Q8WV16 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DCAF4Q8WV16 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DCAF4Q8WV16 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
DCAF4Q8WV16 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DCAF4Q8WV16 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms