Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF42

UBASH3B, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, humanhuman

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3BQ8TF42 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBASH3BQ8TF42 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBASH3BQ8TF42 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBASH3BQ8TF42 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBASH3BQ8TF42 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBASH3BQ8TF42 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBASH3BQ8TF42 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBASH3BQ8TF42 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBASH3BQ8TF42 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBASH3BQ8TF42 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBASH3BQ8TF42 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBASH3BQ8TF42 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBASH3BQ8TF42 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBASH3BQ8TF42 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBASH3BQ8TF42 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBASH3BQ8TF42 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBASH3BQ8TF42 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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