Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC9Q8TBE3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC9Q8TBE3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FNDC9Q8TBE3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNDC9Q8TBE3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms