Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU7

C2CD4A, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4AQ8NCU7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C2CD4AQ8NCU7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C2CD4AQ8NCU7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C2CD4AQ8NCU7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms