Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCB2

CAMKV, CaM kinase-like vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKVQ8NCB2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAMKVQ8NCB2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAMKVQ8NCB2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CAMKVQ8NCB2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms