Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COLGALT1Q8NBJ5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COLGALT1Q8NBJ5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COLGALT1Q8NBJ5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COLGALT1Q8NBJ5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COLGALT1Q8NBJ5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COLGALT1Q8NBJ5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COLGALT1Q8NBJ5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
COLGALT1Q8NBJ5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COLGALT1Q8NBJ5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COLGALT1Q8NBJ5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COLGALT1Q8NBJ5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
COLGALT1Q8NBJ5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COLGALT1Q8NBJ5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COLGALT1Q8NBJ5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COLGALT1Q8NBJ5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COLGALT1Q8NBJ5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COLGALT1Q8NBJ5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COLGALT1Q8NBJ5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COLGALT1Q8NBJ5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COLGALT1Q8NBJ5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COLGALT1Q8NBJ5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COLGALT1Q8NBJ5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COLGALT1Q8NBJ5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COLGALT1Q8NBJ5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COLGALT1Q8NBJ5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms