Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MFSD2AQ8NA29 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MFSD2AQ8NA29 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MFSD2AQ8NA29 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MFSD2AQ8NA29 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MFSD2AQ8NA29 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms