Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6N3

C1orf52, UPF0690 protein C1orf52, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf52Q8N6N3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf52Q8N6N3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf52Q8N6N3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf52Q8N6N3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf52Q8N6N3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf52Q8N6N3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf52Q8N6N3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf52Q8N6N3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf52Q8N6N3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf52Q8N6N3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf52Q8N6N3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf52Q8N6N3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf52Q8N6N3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf52Q8N6N3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
C1orf52Q8N6N3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
C1orf52Q8N6N3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1orf52Q8N6N3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf52Q8N6N3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf52Q8N6N3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms