Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STAG2Q8N3U4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
STAG2Q8N3U4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
STAG2Q8N3U4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
STAG2Q8N3U4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
STAG2Q8N3U4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
STAG2Q8N3U4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STAG2Q8N3U4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STAG2Q8N3U4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
STAG2Q8N3U4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
STAG2Q8N3U4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
STAG2Q8N3U4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STAG2Q8N3U4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STAG2Q8N3U4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STAG2Q8N3U4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STAG2Q8N3U4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
STAG2Q8N3U4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
STAG2Q8N3U4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STAG2Q8N3U4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms