Protein–RNA interactions for Protein: Q86YR7

MCF2L2, Probable guanine nucleotide exchange factor MCF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2L2Q86YR7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MCF2L2Q86YR7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MCF2L2Q86YR7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCF2L2Q86YR7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCF2L2Q86YR7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCF2L2Q86YR7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCF2L2Q86YR7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCF2L2Q86YR7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCF2L2Q86YR7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MCF2L2Q86YR7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCF2L2Q86YR7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCF2L2Q86YR7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCF2L2Q86YR7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCF2L2Q86YR7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCF2L2Q86YR7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCF2L2Q86YR7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCF2L2Q86YR7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCF2L2Q86YR7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCF2L2Q86YR7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCF2L2Q86YR7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCF2L2Q86YR7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCF2L2Q86YR7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCF2L2Q86YR7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCF2L2Q86YR7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCF2L2Q86YR7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MCF2L2Q86YR7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MCF2L2Q86YR7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MCF2L2Q86YR7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MCF2L2Q86YR7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
MCF2L2Q86YR7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCF2L2Q86YR7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCF2L2Q86YR7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCF2L2Q86YR7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCF2L2Q86YR7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCF2L2Q86YR7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCF2L2Q86YR7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MCF2L2Q86YR7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCF2L2Q86YR7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCF2L2Q86YR7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCF2L2Q86YR7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCF2L2Q86YR7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCF2L2Q86YR7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCF2L2Q86YR7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCF2L2Q86YR7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCF2L2Q86YR7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms