Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RBBP6Q7Z6E9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RBBP6Q7Z6E9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RBBP6Q7Z6E9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RBBP6Q7Z6E9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RBBP6Q7Z6E9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RBBP6Q7Z6E9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RBBP6Q7Z6E9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RBBP6Q7Z6E9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RBBP6Q7Z6E9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBBP6Q7Z6E9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBBP6Q7Z6E9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBBP6Q7Z6E9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBBP6Q7Z6E9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBBP6Q7Z6E9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RBBP6Q7Z6E9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RBBP6Q7Z6E9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBBP6Q7Z6E9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBBP6Q7Z6E9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RBBP6Q7Z6E9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RBBP6Q7Z6E9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBBP6Q7Z6E9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBBP6Q7Z6E9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RBBP6Q7Z6E9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBBP6Q7Z6E9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBBP6Q7Z6E9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBBP6Q7Z6E9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBBP6Q7Z6E9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBBP6Q7Z6E9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBBP6Q7Z6E9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBBP6Q7Z6E9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBBP6Q7Z6E9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBBP6Q7Z6E9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBBP6Q7Z6E9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBBP6Q7Z6E9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RBBP6Q7Z6E9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RBBP6Q7Z6E9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RBBP6Q7Z6E9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RBBP6Q7Z6E9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RBBP6Q7Z6E9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBBP6Q7Z6E9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBBP6Q7Z6E9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBBP6Q7Z6E9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms