Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIAT1Q6ZQX7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIAT1Q6ZQX7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIAT1Q6ZQX7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIAT1Q6ZQX7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIAT1Q6ZQX7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIAT1Q6ZQX7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIAT1Q6ZQX7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LIAT1Q6ZQX7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIAT1Q6ZQX7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIAT1Q6ZQX7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIAT1Q6ZQX7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIAT1Q6ZQX7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIAT1Q6ZQX7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIAT1Q6ZQX7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIAT1Q6ZQX7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LIAT1Q6ZQX7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LIAT1Q6ZQX7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms