Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXC1

MAMDC4, Apical endosomal glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAMDC4Q6UXC1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAMDC4Q6UXC1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MAMDC4Q6UXC1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAMDC4Q6UXC1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAMDC4Q6UXC1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAMDC4Q6UXC1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAMDC4Q6UXC1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MAMDC4Q6UXC1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MAMDC4Q6UXC1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MAMDC4Q6UXC1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAMDC4Q6UXC1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAMDC4Q6UXC1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MAMDC4Q6UXC1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MAMDC4Q6UXC1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MAMDC4Q6UXC1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MAMDC4Q6UXC1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MAMDC4Q6UXC1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MAMDC4Q6UXC1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MAMDC4Q6UXC1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MAMDC4Q6UXC1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MAMDC4Q6UXC1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAMDC4Q6UXC1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAMDC4Q6UXC1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAMDC4Q6UXC1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MAMDC4Q6UXC1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAMDC4Q6UXC1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAMDC4Q6UXC1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAMDC4Q6UXC1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAMDC4Q6UXC1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MAMDC4Q6UXC1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAMDC4Q6UXC1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAMDC4Q6UXC1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAMDC4Q6UXC1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAMDC4Q6UXC1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MAMDC4Q6UXC1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MAMDC4Q6UXC1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MAMDC4Q6UXC1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MAMDC4Q6UXC1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MAMDC4Q6UXC1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MAMDC4Q6UXC1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MAMDC4Q6UXC1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MAMDC4Q6UXC1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MAMDC4Q6UXC1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MAMDC4Q6UXC1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MAMDC4Q6UXC1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MAMDC4Q6UXC1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MAMDC4Q6UXC1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MAMDC4Q6UXC1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MAMDC4Q6UXC1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MAMDC4Q6UXC1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MAMDC4Q6UXC1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MAMDC4Q6UXC1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MAMDC4Q6UXC1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MAMDC4Q6UXC1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MAMDC4Q6UXC1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MAMDC4Q6UXC1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MAMDC4Q6UXC1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MAMDC4Q6UXC1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MAMDC4Q6UXC1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
MAMDC4Q6UXC1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
MAMDC4Q6UXC1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms